Özofagusun embriolojik kökeni, kaçinilmaz olarak, öncelikle ön bagirsagin gelismesini tetikleyen ve özellikle trakea, akciger ve midenni farklilasmasindan sorumlu olaylardan etkilenir. Özofagusun gelismesini etkileyen ikincil olaylar ise özofagusun muskuler bir yapi ile sarilmasi ile sonuçlanacak olan menzensimal olaylar ve diyafragmanin gelismesini ve toraks ve abdomen bosluklarinin ayrilmasiyla sonuçlanacak olan olaylarin baslatan mezodermal gelisme ve degisimlerdir.